عنوان انگلیسی: Analysis of L-glutamic acid fermentation by using a dynamic metabolic simulation model of Escherichia coli

عنوان فارسی:

آنالیز فرآیند تخمیر اسید L-گلوتامیک با استفاده از یک مدل شبیه سازی متابولیسم پویا Escherichia coli

نام ژورنال: BMC Systems Biology

سال انتشار: 2013

تعداد صفحات مقاله انگلیسی: 12

تعداد صفحات ترجمه فارسی:25

Abstract
Background: Understanding the process of amino acid fermentation as a comprehensive system is a challenging
task. Previously, we developed a literature-based dynamic simulation model, which included transcriptional
regulation, transcription, translation, and enzymatic reactions related to glycolysis, the pentose phosphate pathway,
the tricarboxylic acid (TCA) cycle, and the anaplerotic pathway of Escherichia coli. During simulation, cell growth was
defined such as to reproduce the experimental cell growth profile of fed-batch cultivation in jar fermenters.
However, to confirm the biological appropriateness of our model, sensitivity analysis and experimental validation
were required.

چکیده

سابقه و هدف: شناخت فرایند تخمیر اسید آمینه به عنوان یک سیستم جامع، یک کار چالش برانگیز است. پیش از این، ما یک مدل شبیه سازی پویا مبتنی بر مقالات گنجانده ایم که شامل تنظیم رونویسی، رونوشت، برگردان و واکنش های آنزیمی مربوط به گلیکولیز، مسیر پنتوز فسفات، چرخه تریکاربوکیلیک اسید (TCA) و مسیر آناپلیروسیک Escherichia coli است.در طی شبیه سازی، رشد سلولی به عنوان مثال برای تولید پروتئین رشد آزمایش سلولی از کشت فریبنده در مخمرهای جاروبی تعریف شد. با این حال، برای تایید مناسب بودن بیولوژیکی مدل ما، آنالیز حساسیت و اعتبار سنجی تجربی مورد نیاز بود.